Первый полногеномный анализ прослеживаемости Brucella abortus в провинции Чжэцзян – группа биоинформатиков из Macro & Micro-Test внесла свой вклад в совместную публикацию.

——— Совместное исследование Центров по контролю и профилактике заболеваний провинции Чжэцзян, компании Macro & Micro-Test и Центров по контролю и профилактике заболеваний Китая опубликовано в журнале Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

Обзор исследования

В мае 2026 года в журнале Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) была опубликована статья, подготовленная под руководством Центра по контролю и профилактике заболеваний провинции Чжэцзян (Zhejiang CDC) при участии группы биоинформатиков из компании Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. и Национального института контроля и профилактики инфекционных заболеваний (China CDC). Название исследования:
«Идентификация и филогенетический анализ семи штаммов Brucella abortus в провинции Чжэцзян, Китай».
Brucella abortus

Данное исследование представляет собой первый систематический анализ филогенетической прослеживаемости Brucella abortus (B. abortus) в провинции Чжэцзян, Китай, на основе полногеномного анализа. Группа исследователей проанализировала семь изолятов, собранных в период с 2015 по 2025 год (четыре штамма человеческого происхождения и три штамма бычьего происхождения из Цзиньхуа, Цюйчжоу и Нинбо). Полученные результаты предоставляют геномные доказательства происхождения и путей передачи этого «северного доминирующего вида» в нетипичном южном эпидемическом регионе восточного Китая.

 

Предпосылки и значение

 

Бруцеллез — это зоонозное заболевание, вызываемое бактериями рода Brucella. Brucella abortus в основном поражает крупный рогатый скот, но может также вызывать заболевания у людей. В Китае бруцеллез демонстрирует значительные географические различия: наибольшая заболеваемость наблюдается в северных провинциях (например, Внутренняя Монголия, Шаньси, Хэйлунцзян). Напротив, в южных провинциях, включая Чжэцзян, исторически преобладала Brucella melitensis, и было зарегистрировано очень мало случаев B. abortus. Это региональное различие делает генетическую характеристику и отслеживание источников B. abortus в Чжэцзяне ключевым приоритетом общественного здравоохранения.

 

Методы и основные выводы

Исследовательская группа применила многостороннюю стратегию, сочетающую молекулярную биологию и биоинформатику:

1.Идентификация патогенов и базовая типизация

ПЦР с использованием гена BCSP-31 и AMOS-ПЦР подтвердили, что все семь изолятов принадлежали к виду B. abortus.

Многолокусное секвенирование (MLST), основанное на девяти генах домашнего хозяйства, показало, что все изоляты принадлежали к секвенционному типу ST2, что указывает на высокую генетическую однородность среди циркулирующих штаммов B. abortus в провинции Чжэцзян.
Идентификация патогенов и базовая типизация

2.Характеристика всего генома

Полногеномное секвенирование проводилось на платформе Illumina NovaSeq. Анализ средней нуклеотидной идентичности (ANI) показал, что изоляты из провинции Чжэцзян имеют сходство до 99,99% с референсным штаммом B. abortus 544.

Пангеномный анализ выявил высококонсервативную популяцию: было идентифицировано 3084 основных гена, а также всего 10 генов оболочки, при этом не было обнаружено генов мягкого ядра или облачных генов.

Фото 1

 

3.Профили генов вирулентности и устойчивости к антимикробным препаратам

В общей сложности было предсказано 68 факторов, связанных с вирулентностью, охватывающих классические пути, такие как биосинтез ЛПС, система секреции T4SS и двухкомпонентная регуляторная система BvrR-BvrS. Примечательно, что у всех изолятов отсутствовали гены адгезинов bmaA и btaF. Анализ генов резистентности выявил в базе данных CARD только ген mprF, других детерминантов резистентности обнаружено не было.

Вирулентность4. Филогенетическая реконструкция и отслеживание передачи генов.

Анализ однонуклеотидных полиморфизмов основного генома (cgSNP) поместил изоляты из провинции Чжэцзян в определенное положение на глобальном филогенетическом дереве. Результаты показали, что штаммы из Чжэцзяна образуют монофилетическую группу вместе со штаммами из России, Монголии и нескольких северных провинций Китая (Нинся, Хэйлунцзян, Внутренняя Монголия, Хэбэй, Ганьсу, Пекин). Эта группа далее разделяется на три отдельных субклада (клады 1–3), что указывает на множественные независимые события интродукции.

Филогенетическая реконструкция

Выводы и последствия

 

Данное исследование представляет собой первый высокоточный набор геномных данных по виду B. abortus в провинции Чжэцзян и позволяет сделать несколько ключевых выводов:

 

  1. Клеar генетическая основа– Штаммы B. abortus, циркулирующие в провинции Чжэцзян, относятся к ST2, обладают высокой степенью геномной консервативности и представляют собой типичную линию возбудителей бруцеллеза крупного рогатого скота.

 

2. Эвипроцент межрегиональной передачи– Филогенетический анализ не подтверждает существование независимой эндемичной линии в провинции Чжэцзян. Вместо этого данные убедительно свидетельствуют о том, что эти штаммы произошли из северного Китая и, возможно, имеют общее эволюционное происхождение со штаммами из России и Монголии. Наличие трех субкладов предполагает несколько отдельных событий интродукции.

 

3. последствия для общественного здравоохранения– Полученные результаты подчеркивают важность геномного мониторинга бруцеллеза даже в традиционно неэндемичных регионах, таких как Чжэцзян. Хотя текущее число случаев невелико, высокоточные инструменты, такие как cgSNP, могут эффективно отслеживать источник завозных вспышек и предоставлять научные доказательства для прерывания цепочек передачи, связанных с межпровинциальной перевозкой скота.

 

Данная работа не только восполняет пробел в исследованиях в провинции Чжэцзян, но и предоставляет новые базовые данные для эпидемиологического надзора за патогенами и оценки риска бруцеллеза в регионе дельты реки Янцзы.

 

Информация о документе:
Ян, Ю., Ши, С., Чен, Дж., Ван, Л., У, З., Яо, В., … и У, Б. (2026). Идентификация и филогенетический анализ семи штаммов Brucella abortus в провинции Чжэцзян, Китай. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 16, 1758965.

 

 


Дата публикации: 10 июня 2026 г.